Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt33bQ61897 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt33bQ61897 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms