Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms