Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RilpQ5ND29 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RilpQ5ND29 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RilpQ5ND29 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms