Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ttf2Q5NC05 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ttf2Q5NC05 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms