Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Usp48Q3V0C5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Usp48Q3V0C5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Usp48Q3V0C5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms