Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnpc3Q3UZ01 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnpc3Q3UZ01 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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