Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca4bQ3UW98 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca4bQ3UW98 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms