Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cln5Q3UMW8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cln5Q3UMW8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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