Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hdgfl2Q3UMU9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hdgfl2Q3UMU9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms