Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Parp8Q3UD82 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms