Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trim71Q1PSW8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trim71Q1PSW8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Trim71Q1PSW8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms