Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rpusd2Q149F1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpusd2Q149F1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms