Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 RPS10BYMR230W 318 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 YNL035CYNL035C 1170 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 SSP2YOR242C 1116 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 PRM4YPL156C 855 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 SAK1YER129W 3429 nt2.28□□□□□ -2.04
USB1Q12208 RPN4YDL020C 1596 nt2.27□□□□□ -2.05
USB1Q12208 AVT5YBL089W 1380 nt2.27□□□□□ -2.05
USB1Q12208 TSC13YDL015C 933 nt2.27□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YGL138CYGL138C 1038 nt2.27□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YMR178WYMR178W 825 nt2.27□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YOL134CYOL134C 390 nt2.27□□□□□ -2.05
USB1Q12208 LDH1YBR204C 1128 nt2.27□□□□□ -2.05
USB1Q12208 PBP2YBR233W 1242 nt2.27□□□□□ -2.05
USB1Q12208 PHO2YDL106C 1680 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 GCV2YMR189W 3105 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RPL35BYDL136W 363 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YDL186WYDL186W 834 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RNH202YDR279W 1053 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 MCR1YKL150W 909 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 SUB1YMR039C 879 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 FIG1YBR040W 897 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 PIS1YPR113W 663 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 TRA1YHR099W 11235 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 FIR1YER032W 2631 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 BNR1YIL159W 4128 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YBR259WYBR259W 2067 nt2.26□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RRI1YDL216C 1323 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YBT1YLL048C 4986 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 MPS2YGL075C 1164 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YIP5YGL161C 933 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 HOT13YKL084W 351 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 PML39YML107C 1005 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 HSP10YOR020C 321 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RRG7YOR305W 729 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YPL276WYPL276W 438 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RRP7YCL031C 894 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 APC5YOR249C 2058 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YEF3YLR249W 3135 nt2.25□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RPS25AYGR027C 327 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YGR168CYGR168C 1131 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 SOL3YHR163W 750 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 SED5YLR026C 1023 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RPS29AYLR388W 171 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 TPT1YOL102C 693 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YOL114CYOL114C 609 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RRG8YPR116W 834 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YOL057WYOL057W 2136 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 DNA2YHR164C 4569 nt2.24□□□□□ -2.05
USB1Q12208 SGS1YMR190C 4344 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 KHA1YJL094C 2622 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 SAD1YFR005C 1347 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 FAR11YNL127W 2862 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 STN1YDR082W 1485 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 IMP3YHR148W 552 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 MMF1YIL051C 438 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YLR042CYLR042C 486 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RPS1AYLR441C 768 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RCE1YMR274C 948 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YNL234WYNL234W 1281 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 SRO77YBL106C 3033 nt2.23□□□□□ -2.05
USB1Q12208 HAA1YPR008W 2085 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 PTP3YER075C 2787 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 KRE33YNL132W 3171 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 FMN1YDR236C 657 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RPL24BYGR148C 468 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 OTU2YHL013C 924 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YHR213WYHR213W 597 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RGI2YIL057C 495 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YIL161WYIL161W 708 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YKL066WYKL066W 444 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YAR062WYAR062W 597 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 NNT1YLR285W 786 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RPL23AYBL087C 414 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YOR114WYOR114W 885 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 LTP1YPR073C 486 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 SIR3YLR442C 2937 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 NAB6YML117W 3405 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 KAR5YMR065W 1515 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 RIT1YMR283C 1542 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 TMA64YDR117C 1698 nt2.22□□□□□ -2.05
USB1Q12208 URB2YJR041C 3525 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 PET100YDR079W 336 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 RSR1YGR152C 819 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 RNR2YJL026W 1200 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 SAW1YAL027W 786 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YJR056CYJR056C 711 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 LAC1YKL008C 1257 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 OMA1YKR087C 1038 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 POP8YBL018C 402 nt2.21□□□□□ -2.06
USB1Q12208 YOR387CYOR387C 621 nt2.21□□□□□ -2.06
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