Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
1700061G19RikQ08EE8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
1700061G19RikQ08EE8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms