Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdx4Q07424 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdx4Q07424 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms