Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1bQ06985 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Siah1bQ06985 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms