Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdcd1Q02242 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdcd1Q02242 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms