Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nme2Q01768 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nme2Q01768 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms