Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PrcdQ00LT2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PrcdQ00LT2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms