Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rbp4Q00724 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rbp4Q00724 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms