Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gabpb1Q00420 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gabpb1Q00420 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms