Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nbr1P97432 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nbr1P97432 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nbr1P97432 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms