Protein–RNA interactions for Protein: P84075

Hpca, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpcaP84075 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
HpcaP84075 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HpcaP84075 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HpcaP84075 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms