Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tubg1P83887 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms