Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nucb2P81117 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nucb2P81117 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms