Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

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Length 650 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sparcl1P70663 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Sparcl1P70663 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Sparcl1P70663 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sparcl1P70663 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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