Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smad1P70340 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smad1P70340 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms