Protein–RNA interactions for Protein: P62322

Lsm5, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm5, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm5P62322 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lsm5P62322 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lsm5P62322 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms