Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snrpd3P62320 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snrpd3P62320 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms