Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rps11P62281 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps11P62281 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms