Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnd3P61588 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnd3P61588 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms