Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tpm2P58774 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tpm2P58774 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms