Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smpdl3bP58242 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Smpdl3bP58242 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms