Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtskP55097 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtskP55097 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtskP55097 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtskP55097 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtskP55097 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtskP55097 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CtskP55097 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms