Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GdnfP48540 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GdnfP48540 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms