Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Edn3P48299 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Edn3P48299 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Edn3P48299 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms