Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TNFSF9P41273 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF9P41273 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms