Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ThpoP40226 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ThpoP40226 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms