Protein–RNA interactions for Protein: P35802

Gpm6a, Neuronal membrane glycoprotein M6-a, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpm6aP35802 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpm6aP35802 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpm6aP35802 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms