Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rab3dP35276 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms