Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stfa3P35173 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stfa3P35173 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms