Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxa11P31311 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa11P31311 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms