Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrkcdP28867 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrkcdP28867 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms