Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hoxd10P28359 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Hoxd10P28359 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Hoxd10P28359 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxd10P28359 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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