Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U2af2P26369 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U2af2P26369 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
U2af2P26369 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
U2af2P26369 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af2P26369 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af2P26369 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U2af2P26369 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms