Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NefhP19246 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NefhP19246 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NefhP19246 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NefhP19246 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NefhP19246 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NefhP19246 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NefhP19246 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NefhP19246 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NefhP19246 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NefhP19246 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NefhP19246 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NefhP19246 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NefhP19246 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NefhP19246 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NefhP19246 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NefhP19246 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NefhP19246 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NefhP19246 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms