Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vpreb1P13372 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms