Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmem254aP0DN89 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem254aP0DN89 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Tmem254aP0DN89 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmem254aP0DN89 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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