Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtatp6P00848 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtatp6P00848 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254.5 ms