Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SNAP29O95721 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SNAP29O95721 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.7 ms